取り急ぎ、疑わしい部分を修正したものをアップしてみました。
https://wp-cocoon.com/wp-content/uploads/2018/04/cocoon-master.zip
よろしければ、こちらでアップデートして試してみていただけると幸いです。

また、上記を適用した状態で、Cocoon設定の、テーマ環境情報をもう一度貼り付けてもらってよろしいでしょうか。

アップデートを行ったところ、無事改善いたしました。
どうもありがとうございます。

テーマ環境設定ですが下記になります。ご参考になれば。

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サイト名：央樹の葉 :: Leaf of Heartwood
サイトURL： https://www.terfes.net/wp
ホームURL： https://www.terfes.net
コンテンツURL： https://www.terfes.net/wp/wp-content
インクルードURL： https://www.terfes.net/wp/wp-includes/
テンプレートURL： https://www.terfes.net/wp/wp-content/themes/cocoon-master
スタイルシートURL： https://www.terfes.net/wp/wp-content/themes/cocoon-child-master
Wordpressバージョン：4.9.5
PHPバージョン：7.2.3
ブラウザ：Mozilla/5.0 (Macintosh; Intel Mac OS X 10_13_4) AppleWebKit/605.1.15 (KHTML, like Gecko) Version/11.1 Safari/605.1.15
サーバーソフト：Apache
サーバープロトコル：HTTP/2.0
エンコーディング：br, gzip, deflate
言語：ja-jp
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テーマ名：Cocoon
バージョン：0.5.2
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子テーマ名：Cocoon Child
バージョン：0.0.3
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利用中のプラグイン：
Akismet Anti-Spam 4.0.3
AmazonJS 0.8
Jetpack by WordPress.com 6.0
WordPress Importer 0.6.4
WPBeginner's Compact Archives 3.0.6
WP Multibyte Patch 2.8.1
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動作確認ありがとうございます！
推測でしたが、無事解決したようで安心しました。

また、環境情報もありがとうございます。
なるほど、wp/サブディレクトリにWordpressコアファイルをインストールして、ホームURLがドメイン直下になっていると、そういった構造になるのですね。
今後の参考にさせていただこうと思います。