僕の環境では見切れてなくて添付画像のように表示されます。
メニューが2段になるのはあまり見た目的にもよろしくないので、メニュー名の文字数を少なくするか、メニューアイテムの数を少なくした方が良いのかもしれません。

●ヘッダー固定の動作
ヘッダー部分、図①が画面外になると、ヘッダーが現れ固定されます。
その際、センターロゴの場合、右寄せに変化します。図③

@yhira さん

@chuya さん

ご返信ありがとうございます。

サイトタイトルやロゴ、そしてメニュー項目が隠れる状態です。

テストサイトではプライベートブラウジングやキャッシュの削除などを試しましたが、正常にスクロール追従できています。

ですが、非公開の本番サイトではやはり変わりませんでした。

ヘッダーを固定する にチェックを入れて、Cocoon 設定の「スキン」タブなどで確認すると、本番サイトでもスクロール追従が正常にされているように見えます。

ですが、サイトを表示させてみると見切れる状態です。

プレビュー画面（本番サイト）のキャプチャ

実際のサイト表示（本番サイト）

adminバーで隠れていると言う事はないですか？

@chu-ya さん

投稿者:: @chu-ya

↑

adminバーで隠れていると言う事はないですか？

WordPress のプロフィールを開き、 「サイトを見るときにツールバーを表示する」のチェックを外すと、adminバーが非表示になりますが、これでヘッダーが正常にスクロール追従するようになりました。

管理バーが非表示だと少し使いにくいかもしれませんが、これで使ってみます。

的確なご回答をくださり、本当にありがとうございました。

@konpeitoro さん

解決されてよかったです。
添付された画像の上に少しだけ黒があり、想像で回答しました。
恐れ入りますが、条件、操作（例：下にスクロール）など、もう少し足して頂けると調査する側としては助かります。

＞わいひら さん
本件の対策の反映要否の判断願います。

●原因
固定ヘッダーに変化した際、top:0で画面上としている。
この為、adminバーがあると、adminバーの高さ分隠れてしまう。
https://github.com/xserver-inc/cocoon/blob/9e5aceed166538bd35b8a2b49aa15fe15d9cca87/tmp/footer-javascript.php#L107-L109

●対策案
[Cocoon設定]→[ヘッダー]→「ヘッダーを固定する」オンの時

adminバーがあるか判定し、adminバー分y座標をずらし、ヘッダーを表示する。

admin_height = 0;
if ($('#wpadminbar').length) {
  admin_height = $('#wpadminbar').outerHeight();
}

$("#header-container").animate({
 'top': admin_height
}, 500);

@chu-ya さん

ヘッダーのスクロール追従が正常に動作しないのは、ヘッダー固定を設定したうえで「サイトを見るときにツールバーを表示する」にチェックを入れた状態で下にスクロールした場合です。

なお、当該サイトはログインが必須のサイトのため、管理バーが表示されている利用者（PC からアクセス）にも影響があると思います。

テストサイトで同じ現象を再現しましたが、その画面キャプチャは以下にアップロードしてあります。

https://gyazo.com/d211c33433392ff4bc5fdfd8cd977b19

調査いただきありがとうございます。

@konpeitoro さん
ありがとうございます。詳細を書いて頂き、現象が明確になり、助かります。
以下の件、次回からでよかったのですが。

投稿者:: @chu-ya

↑

恐れ入りますが、条件、操作（例：下にスクロール）など、もう少し足して頂けると調査する側としては助かります

chu-yaさんありがとうございます！
管理バーがある時にでも固定メニューが表示されていた方が分かりやすいと思うのでコードをそのまま使わせていただきました。
実装したものをGitHubにアップしておきました。
------------------------------------------------
https://github.com/xserver-inc/cocoon
開発中の最新ファイルをダウンロードする場合は、上記ページのダウンロードボタンからzipファイルをダウンロードしてください。

WordPressでの手動アップデート方法はこちら
https://wp-cocoon.com/manual-update-of-cocoon-theme/
------------------------------------------------

----------------------------------------------
テーマ名：Cocoon
バージョン：2.6.2.8
カテゴリー数：19
タグ数：148
ユーザー数：1
----------------------------------------------
対策されている事を確認しました。

adminバーあり

@yhira さん

変数 admin_height に const も let も使われていないです。

https://github.com/xserver-inc/cocoon/blob/a413afef99d0e8df1871e3bcf4cf480f3e55c6e0/tmp/footer-javascript.php#L111

これはまずいので、私であればこのように書きます。

const wpadminbar = document.getElementById('wpadminbar');
const headerContainerTop = wpadminbar ? wpadminbar.clientHeight : 0;

$('#header-container').animate(
  {
    top: headerContainerTop,
  },
  500
);

ご指摘ありがとうございます！
動作しか見てませんでした。修正させていただきました。
https://github.com/xserver-inc/cocoon/commit/04369d7788465e0c02523c6825ec7c1a6deab978

皆さんご回答くださりありがとうございます。

最新版の Cocoon テーマをダウンロードして適用すると、ツールバー表示状態でヘッダーがスクロール追従するようになりました。

いつも迅速な対応をくださり、本当にありがとうございます。

今後ともよろしくお願いいたします。

ご確認いただきありがとうございます！