ご連絡ありがとうございます。
不具合を確認いたしました。
ビジュアルエディターで問題なく選択できていたので、ブロックエディター側のタグも選択できているものと思っていました。
とりあえず、修正方法を調べましたが、すぐにはわからなかったので、一旦この機能は実装停止としたいと思います。
既に停止したバージョンがダウンロードできるようになっています。

今回のアップデートでは「バージョン2.1.1.4に更新します」というメッセージが出たのに、なぜか2.1.2になりました。

これはあまり気にする必要はないです。
既に最新版のファイルはダウンロードできるようになっているだけです。
「バージョン2.1.1.4に更新します」は、自動アップデート情報を更新していないだけで問題ないです。

いつも、ファイルの方を先に公開して、今回のような不具合がないかを確認して、自動アップデート情報を更新しています。
https://wp-cocoon.com/theme-auto-update/

確認ありがとうございます。

チェックリスト形式、下記のページを参考にfunction.phpに追加して今まで使っていました。
https://yuki.world/wp-change-tagbox/

ブロックエディターでも問題なく使えていたのですが、クイック編集には対応していない点が不満でした。
今回Cocoonで新しく追加され、とても嬉しかったのですが残念です。

「バージョン2.1.1.4に更新します」は、自動アップデート情報を更新していないだけで問題ないです。

2.1.1.4からは更新できなかったので、アップデートに何か不具合があったのかと心配していました。
問題ないと言うことで安心いたしました。

では、修正を心待ちにしております。

わいひらさん

導入時の確認が不十分だったようで、申し訳ありません。

https://yuki.world/wp-change-tagbox/
これだと、ブロックエディターでタグ入力エリアが2つできてもしまいますしね…。

http://unnunkannun.com/2017/12/13/post-489/
これも試してみたけど、ブロックイターではダメっぽい。

ただこれらの情報を元に、もう一度時間がある時に、方法を探ってみようと思います。

投稿者:: @leafytree

導入時の確認が不十分だったようで、申し訳ありません。

いえいえ、僕もブロックエディターでしっかり動作確認すべきでした。

これだと、ブロックエディターでタグ入力エリアが2つできてもしまいますしね…。

そういえばそうでした。
普段はデフォルトのタグ入力エリアを非表示にしているので忘れていました。
それに、デフォルトの位置（カテゴリーの下）ではなく、別のメタボックスになってしまうんですよね。

とても便利な機能ですが、なくてもなんとかなるなので気長に待ちます。
良い方法が見つかるといいですね。

このトピックは、TODOとして、要望フォーラムに移動しておきます。

https://nldot.info/how-to-change-the-tags-to-checkbox-in-gutenberg/
久しぶりに上記のカスタマイズを試してみたら、なんか正常動作しているようです。
WordPressで修正があったのかもしれません。

なので、以前の機能を元に戻しておきました。
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https://github.com/yhira/cocoon
最新ファイルをダウンロードする場合は、上記ページのダウンロードボタンからzipファイルをダウンロードしてください。

FTPでのアップデート方法はこちら。
https://wp-cocoon.com/ftp-update/
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僕の環境では、タグ情報も問題なく保存されているようです。

Cocoon設定「エディター」タブから設定を元に戻しても、元の情報は保持されているようです。

先ほど気が付いて、無事に動作することを確認しました。WordPressのバグだったのでしょうかね。

これで管理が楽になります。ありがとうございました。