ご連絡いただきありがとうございます。
取り急ぎ確認してみたところ楽天ページの仕様が変わったみたいですね。
修正に取り掛かろうと思います。
ただ楽天ページの齟齬を回避するためエラが出るページのURLを教えていただいてよろしいでしょうか。
※僕が指定するのでもどちらでも良いですが色々なページに対応しているため、まずはpipicoさんがブックマークレットを利用したいページURLを教えていただければ幸いです。

とりあえず以下のURLをクリックするとエラーが出るブックマークレットのURL部分に貼り付けて実行するとどうなりますか？

javascript: (function() {
	var url = location.href;
	var host = location.host;
	var item_code = null;
	var shortcode = null;
	var title = null;
	if(host == 'item.rakuten.co.jp') {
		var scripts = document.getElementsByTagName('script');
		for(var i = 0; i < scripts.length; i++) {
      var script = scripts[i].innerHTML;
      if (script) {
        var m = script.match(/itemid:\['(.+?)'\],/);
        if(m) {
          item_code = m[1];
        }
      }
		}
		var metas = document.getElementsByTagName('meta');
		for(var i = 0; i < metas.length; i++) {
			if(metas[i].getAttribute('name') == 'twitter:title') {
				title = metas[i].getAttribute('content')
			}
		}
		shortcode = '[rakuten id="' + item_code + '" kw="' + title + '"]'
	} else if(host == 'product.rakuten.co.jp') {
		var elements = document.getElementsByClassName('topProduct__specsInfo');
		var code_no = null;
		for(var i = 0; i < elements.length; i++) {
			code_no = elements[i].innerText.trim();
			if(code_no.match(/(EAN|JAN|ISBN|UPC)/)) {
				item_code = code_no.replace(/[A-Z]+?: /, '');
				break
			}
		}
		var elements = document.getElementsByClassName('topProduct__title');
		for(var i = 0; i < elements.length; i++) {
			var spans = elements[i].getElementsByTagName('span');
			for(var j = 0; j < spans.length; j++) {
				if(spans[j].getAttribute('itemprop') == 'name') {
					title = spans[j].innerText.trim()
				}
			}
		}
		shortcode = '[rakuten no="' + item_code + '" kw="' + title + '"]'
	} else if(url.match(/(books\.rakuten\.co\.jp\/(rb|rk|rd)|biccamera\.rakuten\.co\.jp\/item)\//)) {
		var element_shop_code = document.getElementById('ratShopUrl');
		shop_code = element_shop_code.getAttribute('value');
		var element_item_code = document.getElementById('ratItemId');
		item_code = element_item_code.getAttribute('value');
		item_code = item_code.split('/')[1];
		title = document.getElementById('productTitle') || document.getElementsByClassName('p-productDetail__title')[0];
		title = (title ? title.innerText : '').trim().replace(/\r?\n|[\[\]]/g, ' ');
		shortcode = '[rakuten id="' + shop_code + ':' + item_code + '" kw="' + title + '"]'
	} else {
		alert('Error:%E3%83%96%E3%83%83%E3%82%AF%E3%83%9E%E3%83%BC%E3%82%AF%E3%83%AC%E3%83%83%E3%83%88%E3%81%AE%E3%82%B5%E3%83%9D%E3%83%BC%E3%83%88%E7%AF%84%E5%9B%B2%E5%A4%96%E3%81%AE%E3%83%9A%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%81%A7%E3%81%99%E3%80%82')
	}
	if(shortcode) {
		if(item_code) {
			if(shortcode = prompt('%E3%82%B3%E3%83%94%E3%83%BC%E3%81%97%E3%81%A6%E3%81%8F%E3%81%A0%E3%81%95%E3%81%84%E3%80%82', shortcode)) {
				var r = document.createRange();
				var text = document.createTextNode(shortcode);
				r.selectNode(document.body.appendChild(text));
				window.getSelection().addRange(r);
				document.execCommand('copy');
				text.remove()
			}
		} else alert('Error:%E3%82%B3%E3%83%BC%E3%83%89%E3%81%8C%E8%A6%8B%E3%81%A4%E3%81%8B%E3%82%8A%E3%81%BE%E3%81%9B%E3%82%93%E3%81%A7%E3%81%97%E3%81%9F%E3%80%82')
	}
})();
void(0);

とりあえず、楽天通常ページ、楽天ブックスページ、楽天ブックス電子書籍ページでショートコードが生成できることは確認しました。
https://item.rakuten.co.jp/kyorindo/4987110004240/?s-id=top_normal_browsehist&xuseflg_ichiba01=10000881
https://books.rakuten.co.jp/rb/17354067/?l-id=search-c-item-text-03
https://books.rakuten.co.jp/rk/f5c9830161143f6f9d87e68b180b2624/?l-id=item-c-kobo-title

わいひらさま。お世話になっております。

返信が遅れてしまい申し訳ありません。

まず使用したいURL一つ置いておきます。

【楽天市場】【クーポン利用で1790円】ミニ トートバッグ レディース トートバッグ キャンバス 3つ仕切り ミニトート 仕切り収納＆マチ大容量 毎日に便利で大満足 キャンバスミニトートバッグ マザーズバッグ ママバッグ ランチバッグ B5収納 収納[一部予約販売]：京童工房 (rakuten.co.jp)

また仰られた貼り付けをする部分がいまいちわからず。(すみません。。。)

(楽天市場通常商品ページでバーにあるブックマークレットボタンを押すと

Error:コードが見つかりませんでした。の表示がグレーバックにでるのみでURL入力できる空欄はでません

送っていただいたキングダム楽天ブックスではショートコードURLがもともと表示されるので入力できる空欄は表示されます。)

ですので楽天市場商品にてURLバーのURLと、ブックマークする場合のURL後方に送ってもらったURLを貼付してみましたがアクセス集中の画面が表示されてしまいます。

やりかたが理解できてないかと思います。お手数おかけして申し訳ありません。

画像がどうしてもキャプチャ出来なかったので

こちらにカメラで撮ったもの貼らせていただきます！ブックマークレットボタンを押した時に表示されるエラー画面がこちらになります。

ブラウザによってやり方が違うのですがChromeですと「エラーが出るブックマークレット」を右クリックして「編集」メニューを選択するとURLを入力するダイアログが表示されるかと思います。

僕の環境では頂いたURLで以下のようなショートコードが出力されました。

[rakuten id="eunicedress:10001680" kw="【楽天市場】【クーポン利用で1790円】ミニ トートバッグ レディース トートバッグ キャンバス 3つ仕切り ミニトート 仕切り収納＆マチ大容量 毎日に便利で大満足 キャンバスミニトートバッグ マザーズバッグ ママバッグ ランチバッグ B5収納 収納[一部予約販売]：京童工房"]

@yhira わいひらさま！ご丁寧にやり方ありがとうございます！

ご教授いただいた方法でURL貼り付けしたところリンクの出力できるようになりました！

クロームとMicrosoft　edgeどちらでも使用できるようになりました。

ありがとうございました。

ご確認いただきありがとうございます。
後はブックマークレットの説明ページに反映させておこうと思います。