CSSで非表示にできると思いますよ。

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<li class="cat-item cat-item-3"><a href="https://wp-cocoon.com/category/theme/theme-settings/" class="">テーマ設定<span class="post-count">133</span></a><ul class="children"><li class="cat-item cat-item-51"><a href="https://wp-cocoon.com/category/theme/theme-settings/amp/" class="">AMP<span class="post-count">6</span></a></li><li class="cat-item cat-item-35"><a href="https://wp-cocoon.com/category/theme/theme-settings/ads/" class="">広告設定<span class="post-count">8</span></a></li><li class="cat-item cat-item-36"><a href="https://wp-cocoon.com/category/theme/theme-settings/skins/" class="">スキン<span class="post-count">22</span></a></li><li class="cat-item cat-item-38"><a href="https://wp-cocoon.com/category/theme/theme-settings/analytics/" class="">アクセス解析<span class="post-count">6</span></a></li><li class="cat-item cat-item-42"><a href="https://wp-cocoon.com/category/theme/theme-settings/singular-page/" class="">投稿・固定ページ<span class="post-count">15</span></a></li><li class="cat-item cat-item-49"><a href="https://wp-cocoon.com/category/theme/theme-settings/amazon/" class="">Amazon商品リンク<span class="post-count">19</span></a></li><li class="cat-item cat-item-50"><a href="https://wp-cocoon.com/category/theme/theme-settings/rakuten/" class="">楽天商品リンク<span class="post-count">8</span></a></li><li class="cat-item cat-item-39"><a href="https://wp-cocoon.com/category/theme/theme-settings/widgets/" class="">ウィジェット<span class="post-count">5</span></a></li></ul></li>

この場合はテーマ設定のlist全てを指定し、削除する場合です。

.widget-sidebar .cat-item.cat-item-3 {
	display:none;
}

https://gyazo.com/a5b7f4d8b78b6b062d123353f2125570

上：ビフォー。下：アフター

https://gyazo.com/01fef1056102b1c50e4e18f486f05677

実際に試してはないですが、以下を子テーマのfunctions.phpに追記すれば多分できるのではないかと思います。

add_filter( 'widget_categories_args', 'exclude_widget_categories');
function exclude_widget_categories( $args){
  //非表示にする投稿IDをカンマ区切りで記入
  if (is_single( array( 9, 15, 100 ) )) {
    $args['exclude'] = '3,6,18'; // 除外するカテゴリーのIDをカンマ区切りで指定
  }  
  return $args;
}  

IDなどは、環境に合わせて変更してください。

かうたっくさん、わいひらさん、ありがとうございます。

私の書き方が悪くうまくお伝えできずすみません。

例えば https://wp-cocoon.com/how-to-skin-update/のページですと

カテゴリーが　お知らせ ＞ お願い

ですので、大カテゴリーの「お知らせ」と子カテゴリー「お願い」「アップデート情報」のみを表示して

あとのカテゴリーは非表示にしたいという意味になります。

わいひらさんの方法を試そうと思ったのですが、自サイトの投稿ページ数とカテゴリー数が多いため、全て入力するのが困難と思いました。

かうたっくさんの方法は試したのですが、個別投稿ページごとにできるのかわかりませんでした。

色々書いていただいたのに大変申し訳ないですが、ご教示いただけますと幸いです。

どうぞ宜しくお願いいたします。

個別投稿ページごとにできるのかわかりませんでした。

記事下にある『カスタムCSS』に書けば簡単ですので、お試しください。

かうたっくさん、ありがとうございます！

記事下に「カスタムCSS」があるのを忘れていました(^_^;)

試したら出来ました！いつもご丁寧にありがとうございます！

今後ともどうぞ宜しくお願いいたします。