僕の環境で試してみたのですが、不具合は再現できませんでした。

出来れば、実際のページのURLと該当場所教えていただければと思います。

またテーマの環境情報もいただければと思います。

https://wp-cocoon.com/theme-report/

現物は直してしまったので、サンプルを準備して実験しました。
ご覧ください。

https://ygkb.jp/link-test-page
（記事ソースはこちらです）

■実験結果

問題が2点ありました（赤字）。

• リンク1(a href)…正常動作です
• リンク2(a HREF)…外部リンクのはずが、内部リンクアイコンになっています
• リンク3(A href)…アイコンは正しいですが、nofollow指定が抜けています
• 「リンクアイコンが表示されない」のは自分の見間違いでした。
  すみませんm(_ _)m

■考察

• テキストモードのまま記事を更新すると問題発生します。
• しかし、一度ビジュアルモードに切り替えてから更新すると問題解消します。
  （ビジュアルモード切り替え時にタグが小文字に自動整形されるため）
• ほとんどの人はビジュアルモードとテキストモードを行き来しながら記事を書くでしょうから問題が表面化することは殆ど無いでしょう。
• 自分の場合「Advanced Ads」プラグインでASPタグを埋め込んでいたので自動整形に引っかからず、問題が表面化しました（これは自分がAdvanced～側の設定を修正してゆくしかない）

■環境情報

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サイト名：有限工房
サイトURL： https://ygkb.jp 
ホームURL： https://ygkb.jp 
コンテンツURL：/wp-content
インクルードURL：/wp-includes/
テンプレートURL：/wp-content/themes/cocoon-master
スタイルシートURL：/wp-content/themes/cocoon-child-master
子テーマスタイル：/wp-content/themes/cocoon-child-master/style.css
Wordpressバージョン：5.1.1
PHPバージョン：7.2.6
ブラウザ：Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; Win64; x64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/73.0.3683.75 Safari/537.36
サーバーソフト：Apache
サーバープロトコル：HTTP/1.1
言語：ja,en-US;q=0.9,en;q=0.8,und;q=0.7
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テーマ名：Cocoon
バージョン：1.7.0
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子テーマ名：Cocoon Child
バージョン：1.0.6
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Gutenberg：0
AMP：0
PWA：0
ホームイメージ：/wp-content/themes/cocoon-master/screenshot.jpg
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ブラウザキャッシュ有効化：1
HTML縮小化：0
CSS縮小化：0
JavaScript縮小化：0
Lazy Load：1
WEBフォントLazy Load：1
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利用中のプラグイン：
AddQuicktag 2.5.3
Advanced Ads 1.13.3
All-in-One WP Migration 6.86
AmazonJS 0.9
BackWPup 3.6.8
Broken Link Checker 1.11.5
Contact Form 7 5.1.1
Duplicate Post 3.2.2
Enable Media Replace 3.2.9
Google XML Sitemaps 4.1.0
Jetpack by WordPress.com 7.1.1
Optimize Database after Deleting Revisions 4.7.4
plugin load filter 3.1.0
Redirection 4.1
Regenerate Thumbnails 3.1.0
Search Regex 1.4.16
Shortcoder 4.3
Shortcodes Ultimate 5.3.0
SiteGuard WP Plugin 1.4.3
TinyMCE Advanced 5.1.0
TinyMCE Clear Float 1.3.2
WebSub/PubSubHubbub 3.0.2
WP-Piwik 1.0.19
WP Multibyte Patch 2.8.2
Ygkb Functions 0.0.1-20170112
Ygkb Quick Ad Insert 1.1
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以上です。

ソースコードありがとうございます！
おかげですぐに不具合テストに取りかかれました。

どうやら、ブロックエディター（Gutenberg）だと自動的に大文字のAタグがaに変換されてしまうみたいですね。
ビジュアルエディターでないと再現できないものだったみたいです。

修正したものを、以下にアップしておきました。

https://github.com/yhira/cocoon
最新ファイルをダウンロードする場合は、上記ページのダウンロードボタンからzipファイルをダウンロードしてください。

度々お手数掛けますm(_ _)m

記事ソースはそのままでCocoonをバージョンアップ後、再度表示させました。

https://ygkb.jp/link-test-page

• リンク1…OK
• リンク2…内部リンクアイコンのまま
• リンク3…OK

以上です。

修正しておきました。
ダウンロード先は前回書き込んだものと同じです。

お返事遅れましてすみません！

アイコン直りました！(^o^)

ご対応ありがとうございました。

動作確認ありがとうございます。