ソースコードが圧縮されていると見づらいので、以下の方法で縮小化を解除していただいてよろしいでしょうか。
https://wp-cocoon.com/theme-trouble/
ただし、サポート対象外のものにもあるように、独自カスタマイズの不具合は、基本的にサポート外とさせていただいているので、原因がわからない可能性もあるのであらかじめご了承ください。

あとよろしければ、環境情報もいただければと思います。
https://wp-cocoon.com/theme-report/

わいひら様

いつもお世話になっております。ご連絡頂きありがとうございます。

・縮小化を外しました。

・環境情報は以下の通りです。

----------------------------------------------
サイト名：東埼玉自動車教習所
サイトURL： https://hsds-menkyo.com
ホームURL： https://hsds-menkyo.com
コンテンツURL：/wp-content
インクルードURL：/wp-includes/
テンプレートURL：/wp-content/themes/cocoon-master
スタイルシートURL：/wp-content/themes/cocoon-child-master
子テーマスタイル：/wp-content/themes/cocoon-child-master/style.css
スキン：/wp-content/themes/cocoon-master/skins/skin-mixgreen/style.css
Wordpressバージョン：5.2.4
PHPバージョン：7.2.23
ブラウザ：Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; Win64; x64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/78.0.3904.70 Safari/537.36
サーバーソフト：LiteSpeed
サーバープロトコル：HTTP/1.1
エンコーディング：gzip, deflate, br
言語：ja,en-US;q=0.9,en;q=0.8
----------------------------------------------
テーマ名：Cocoon
バージョン：1.9.9.5.3
カテゴリ数：5
タグ数：0
ユーザー数：1
----------------------------------------------
子テーマ名：Cocoon Child
バージョン：0.0.4
----------------------------------------------
Gutenberg：1
AMP：0
PWA：0
Auto Post Thumbnail：0
ホームイメージ：/wp-content/uploads/2018/07/タマオ.jpg
----------------------------------------------
ブラウザキャッシュ有効化：1
HTML縮小化：0
CSS縮小化：0
JavaScript縮小化：0
Lazy Load：0
WEBフォントLazy Load：0
JavaScript（フッター）：1
----------------------------------------------
利用中のプラグイン：
Akismet Anti-Spam 4.1.2
All-in-One WP Migration 7.9
Better Delete Revision 1.6.1
Classic Editor 1.5
Gallery Custom Links 1.2.3
Jetpack by WordPress.com 7.8
PS Auto Sitemap 1.1.9
Shortcodes Ultimate 5.6.0
----------------------------------------------

お忙しいところ申し訳ございませんが、宜しくお願い致します。

あと10・20分時間をかけたら、何を伝えようとされているのか、イロイロクリックしたりすれば分かるかも知れないです。

• どのページのここが変。ココを直したい。

と教えていただけますか。

*********

あと、

分かる部分だけでも返信したかったんですけど、だれが書いたCSSか全くわからないです。

• cocoon設定・高速化にある縮小化に加えプラグインの
  高速化・縮小化　など一時的に停止してみてください

見ようとした人が「見にくい」、それを伝えるのも面倒という理由で
スルーされない。かも？れないです。

質問する際、高速化・圧縮・縮小化などを、停止しておくのが良いと思います＾＾

かうたっく様

ご返信ありがとうございます。至らない部分が多々あり申し訳ございません。

もともとは添付ファイルのようにインデックスやヘッダーの下部に線がありませんでした。(以前教わりましたCSSでカスタマイズしていました。)

/* エントリーカードラベル非表示 */
.entry-card .cat-label{
display: none;
}

/* ---------------------------------------------------------
/ 『エントリーカード』
/
/ ・背景色＋borderカラー＋マウスオーバーでふわっと浮かせる
--------------------------------------------------------- */
/* ----- 背景色 ----- */
.a-wrap {
background-color: #ffffff;
-webkit-transition: all .5s;
transition: all .5s;
}

/* ----- border ----- */
.a-wrap .blogcard {
border-color: #8cc9ac;
}

/* ----- ふわっと浮かせる ----- */
.a-wrap:hover {
background-color: transparent;
-webkit-transform: translateY(-5px);
-ms-transform: translateY(-5px);
transform: translateY(-5px);
box-shadow: 0 14px 28px rgba(0,0,0,0.25), 0 10px 10px rgba(0,0,0,0.22);
}

Cocoonの1.9.9.5.3にアップデートした際に上記のCSSが反映されなくなったイメージです。

プラグインは一度全て停止して試しましたが特に変化がありませんでした。時間ができたらもっと時間をかけて深く調べたいと思います。

ご迷惑をおかけして申し訳ございませんでした

とりあえずAについては以下のサイトでも同様に出ているようですが。
https://hsds-menkyo.com/test-scr/

Bについては、こちらのスキンのスタイルが適用されています。

スキン：/wp-content/themes/cocoon-master/skins/skin-mixgreen/style.css

スキンを外せば改善されるかと。

Cに関しては、Shortcodes Ultimateのスタイルが影響しているので、テーマは関係ないように思います。
https://hsds-menkyo.com/wp-content/plugins/shortcodes-ultimate/includes/css/shortcodes.css

Dに関しても、こちらのスキンが影響しているように思います。

スキン：/wp-content/themes/cocoon-master/skins/skin-mixgreen/style.css

Aはいらない。消したい。ってことでしょか？？？

もしそうであればスキンの記載が原因です。

h
ttps://hsds-menkyo.com/wp-content/themes/cocoon-master/skins/skin-mixgreen/style.css

.header-container{
  box-shadow: 0 6px 5px -3px rgba(0,0,0,0.24),
                0 6px 10px -3px rgba(0,0,0,0.18);
}

スキンをはずすと表示されないと思いますよ

わいひら様

ご連絡遅くなり申し訳ございません。本日スキンを外してみたところ、アップデート前の見た目に戻りました。これまでミックスグリーン(スキン)を使い続けてきてのでスキンという発想に至らなかったです。貴重なお時間をかけさせてしまい申し訳ございません。重ねて詳しく、ご丁寧に回答を頂き心より感謝申し上げます。

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かうたっく様

ご連絡遅くなり申し訳ございません。Aの部分も教えて頂いた通りスキンを外すことで解決致しました。お手数をおかけしてしまい申し訳ございません。解決法を教えて頂き心より感謝申し上げます。