使用しているのはどのスキンでしょうか？
たぶん1.7.8あたりから、AMPではスキンのスタイルを利用しない制御が追加されているので、その影響かもしれません。

AMPではCSSの容量が50KB程度までと決められているので、CSSの容量が大きいスキンでAMPエラーにならないよう対処するためだと思います。

AMPページでCSSが50,000Byte（約50KB）を超える「無効なCSSエラー」が出た場合の対処方法

ご返信ありがとうございます。

現在は1.7.7に戻してしまいましたが、
スキンの種類問わずAMPページに反映されていませんでした。
Cocoonの各ページ内でも?amp=1を追加してAMPページを表示するとスキンが外れています。

該当ページは確認したのですが、「スキンのスタイルを有効にする」のチェックボックスも固定（押されたまま）で弄れないような状態でした。

AMPページではCSSサイズが約50KB以上あるとAMPエラーになります。
AMPエラーが出ては、結局のところGoogleにキャッシュされずAMP化する意味はないので、CSSサイズが大きくAMPエラーが出るようなスキンは、スキン側から制御してAMPページでは適用しない仕様にしてあります。

スキン制御を外す方法もないわけではないですが、まずはロコさんの質問の、以下の答えが必要です。

使用しているのはどのスキンでしょうか？

わいひら様
お返事ありがとうございます。
回答が遅くなり申し訳ありません。

使用していたスキンはモダンブラックになります。
1.7.7系の頃まではAMPページにもスキンが適用されていたのですが、
1.7.8.2にアップデートしたところスキンなしの状態となっていました。

仕様との事で了解しました。
お手数をおかけしました。
これからもよろしくお願い致します。

「モダンブラック」スキンの場合、AMPページでも、スキンを適用する場合は以下の手順で行うと利用できます。

1. 親テーマのskinsフォルダ内からskin-modernblackフォルダをコピー
2. 子テーマのskinsフォルダ内に貼り付け
3. 子テーマ内のskins/skin-modernblackフォルダを開く
4. option.csvファイルを開く
5. amp_skin_style_enable,0の一行を削除
6. Cocoon設定から子テーマ側の「モダンブラック」スキンを選択する

このようにすることで、スキンもカスタマイズすることができます。
子テーマに移動したことで、親テーマのアップデートの影響も受けません。

ただ、AMPページでスキンを適用して、AMPエラーが出た場合は、結局キャッシュされないので、その辺は自前で対応していただく必要があります。

わいひら様

いつもありがとうございます。
対処方法まで教えて頂き助かります。

教えて頂いた通り運用させて頂きます。