その後解決しましたでしょうか？
僕もちょうど同様のことをやろうとしていて、参考にしたかったのですが。

全く同じ状態の動作環境もないので、ちょっとアドバイスのしようがありません。

<div id="list" class="list<?php echo get_additional_entry_card_classes(); ?>">

以下に

<?php
$my_blogs = wp_get_sites(); 
foreach ( $my_blogs as $blog ):
    switch_to_blog( $blog );
?>
	<?php
		$args = array( 'posts_per_page' => 5 );
		$the_query = new WP_Query( $args );
		if ( $the_query->have_posts() ) :
			while ( $the_query->have_posts() ) :
				$the_query->the_post();
	?>

一覧の繰り返し処理※テーマファイルのまま。
<!-- .list -->//※ここまでテーマファイルのまま。
<?php endwhile; endif; restore_current_blog(); endforeach; ?>

上記の表示がおかしいソース部分はこちらになります。

大変失礼いたしました。

現在サブディレクトリ型マルチサイトを構築中で、親サイトに子サイトの最新投稿を表示したいと思っています。(テーマはすべてコクーンです。）

１つの親フォルダからサイト別に子テーマを呼び出して構築しています。

list.phpの

	 5 );
		$the_query = new WP_Query( $args );
		if ( $the_query->have_posts() ) :
			while ( $the_query->have_posts() ) :
				$the_query->the_post();
	?>
////////////////////////////
//一覧の繰り返し処理※テーマファイルのまま。
////////////////////////////
endif;
?>

と追記しました。

初心者ですので他のHPを参考にして実装しているので、ソース自体がおかしい可能性もありますのでその点ご容赦くださいませ。

ページネーションが管理画面の「1ページに表示する最大投稿数」の影響か

おかしな表示になってしまいました。

（最大投稿数値を変えるとページネーション数が変わったため。）

恐れ入りますが、テーマ上の構造から言える

アドバイス等あればお教えいただけないでしょうか。

本当にお手隙の際で全く構いませんので、教えて頂けると幸いです。